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原绿球藻直径约为0.6μm，是已知的最小的光合有机体。同时也是地球上最丰富的光合生物。使用CytoSense浮游植物流式细胞仪对海洋原绿球藻进行定量分析，可了解其在海洋生态系统中的作用。

近期，荷兰Geestmerambacht娱乐公园湖中出现早期有害藻华（HAB），为此荷兰水环境管理司与CytoBuoy 公司利用CytoSense扫描成像藻类流式细胞仪对藻华样本进行了分析，经分类学家鉴定为红色浮丝藻。